
在深圳湾红树林,每逢假日总能看到家长带着孩子,手持望远镜、满怀期待地等待鸟儿翩跹的身影,观念——已成为这里一道动人的生态风景线。然而,红树林的价值远不止于此。它不仅是鸟类栖息的乐园,更被誉为“蓝色碳汇”的守护者,固碳防蚀,还孕育着丰富的微生物群落。近日,北部湾大学、深圳生态环境监测中心站以及南方科技大学等单位的研究人员在《科学数据》(ScientificData)期刊发表重磅成果,成功从中国广西红树林沉积物中重建近3000个微生物基因组,揭示了这些生态系统的微生物多样和功能潜力。
该研究次构建了高分辨率的红树林微生物基因组数据集,证明细菌主要隶属于Chloroflexota、Desulfobacterota和Pseudomonadota,古菌则以Thermoproteota和Asgardarchaeota为主,为研究微生物在蓝碳循环中的作用提供了宝贵资源。
这一突破也是红树林生态监测领域的重要进展,华大智造的DNBSEQ测序平台T1+和2000RS为研究提供了核心工具支撑,以10.3TB的超大数据量、78个微生物门类的超高覆盖度,动红树林生态监测与微生物适应研究进入新阶段。研究团队通过统一标准流程,既解析了红树林沉积物的“微生物密码本”(基因组),铝皮保温又记录了不同深度、不同区域的“群落组成动态”(分类学组成),实现了遗传信息与生态信息的精准对应,相当于为广西红树林微生物世界拍摄了一套全方位、多层次的“基因全景图”。
自主测序技术解码红树林的微观世界要揭开红树林沉积物中微生物世界的奥秘,要挑战便是如何从成分其复杂、有机质含量高的环境样本中,精准、全面地捕获那些含量微却至关重要的微生物基因信息。传统的研究方法难以突破这一瓶颈。本研究的突破,正得益于自主基因测序技术的强力驱动。T1+平台如同一台不知疲倦的“超高清扫描仪”:作为目前全球Tb级桌面型测序仪中速度快的机型之一,日产出1.2Tb的测序数据,24小时可完成从文库上机到拆分和产出FASTQ的PE150测序任务,碱基质量Q40达到90%以上,保证了基因组拼装的准确与完整,让科研人员能够信赖这些数据并深入开展功能解析。
地址:大城县广安工业区更重要的是,华大智造提供从样本制备、文库构建到上机测序的全流程工具方案,能够确保实验流程的标准化与高,使得如此大规模的环境微生物基因组学研究得以顺利实施。华大智造环境DNA宏条形码测序组产品,覆盖从采样到报告全流程,能够对环境样本中的生物群落结构进行快速、准确的分析,为生态环境监测与生物多样研究提供工具支撑。
文|记者林园
